System WCS odpowiada za harmonogramowanie pomiędzy systemem a urządzeniami oraz wysyła polecenia wydawane przez system WMS do każdego urządzenia w celu skoordynowanego działania. Pomiędzy urządzeniem a systemem WCS istnieje ciągła komunikacja. Gdy sprzęt wykona zadanie, system WCS automatycznie dokona przekazania danych do systemu WMS.